Im Herbst 2003 setzte Runrig die alten Erfolge fort und stieg mit dem Album „Proterra“ auf Platz 10 in die deutschen Album Charts ein. Anders als die früheren Alben setzten Runrig bei „Proterra“ auf popige Elemente in Verbindung mit schottischen – kubanischen und brasilianischen Klängen. Dies ist mit Sicherheit auch dem in Brasilien lebenden Musiker Paul Mounsey zu verdanken, der an dem Album aktiv mitgewirkt hat und schon auf dem Album „The Stamping Ground“ beim Lied „Running to the light“ bedeutende Akzente setzte.
Das 30 jährige Bandjubiläum wurde mit einem Konzert auf der Stirling Castle Esplanade und der Veröffentlichung der Live DVD Day of Days gebührend gefeiert. Zahlreiche Live-Auftritte in Europa folgten.
2007 erschien das Album „Everything you see“ und am 18. August 2007 spielten Runrig vor 17.000 Fans am Loch Ness ein unvergessliches Konzert. Unvergesslich deshalb, weil die Fans über 10 Stunden im strömenden Regen auf die Band warteten und trotzt des „Day of the flood“ die Band begeistert feierten. Im Jahr 2008 erschien dieses Konzert auf DVD und CD.